關于中醫的起源有多種說法，一種說法是傳統的英雄史觀，就是中醫由古代的圣賢創立，比如說嘗百草的神農以及黃帝、扁鵲等傳說中的人物，現在是人民史觀，認為是古代勞動人民創造了中醫，但不管怎么說，中醫的產生和古代的巫術、宗教都有很密切的關系。
在中醫發展史上，有不少名醫都是道士，比如孫思邈，葛洪既是道士，又是名醫。由于中醫的發展過程中受到巫術和宗教的影響，中醫也不可避免出現巫術的影子，這其中有影響力的就是祝由術。
中醫最早的典籍《黃帝內經》中就有祝由術的記載，黃帝問曰：“余聞古之治病，惟其移精變氣，可祝由而已”。翻譯過來就是黃帝問道，我聽說古時治病，只要對病人移易精神和改變氣的運行，用一種“祝由”的方法，病就可以好了。由此可見祝由科有很悠久的歷史，從古人的論述來看就是一種通過咒語、手勢來治療疾病的療法。
祝由科，從唐代就列入太醫署第十三科。但在古代名醫的書中記錄很少，有的只是一鱗半爪的記載，也沒有操作方法，但在一些文人的筆記野史中反而有一些治病的神奇事例，比如清代學者趙翼就曾親眼見過祝由術治外傷的例子。總的來說，祝由術適合治療外傷、出血、魚刺卡喉等急癥，但是起源、具體操作和效果一直神龍教首不見尾。
初中時候，聽同桌講，他家有長輩會念咒語治魚刺卡喉。大學同學有一個來自貧困的少數民族地區，據他講，當地少數民族治療精神類疾病，就是讓一頭動物圍著患者轉圈，然后醫師（巫師）念咒語，做特定的手勢，走特定的步伐治病，據說效果還不錯。
按照現代科學的觀點，祝由術應該是一種類似心理、氣功類療法，但是現代心理學并不能完全解釋祝由科治病的原理。
