道家常常用「一」標示陰，用「一」標示陽，卦學上以陰陽作為基數，將其稱之為爻。所謂離卦或坎卦，是「三」和「蘭」，由三爻組成的，離卦的上下兩爻為「一」，中間一爻為「一」，即表示外陽內陰，稱之為離中虛；坎卦的上下兩爻為「一一」，中間一爻為「一」，表示外陰內陽，稱之為坎中滿，也即陽中有陰，陰中有陽。可見，只有用三，才能表達完美。而真正成為卦象，則是由兩卦六爻組成，以顯示陰陽上下交流，負陰抱陽，事物的既協調又紛繁複雜的現象。可見萬物的變化都是可以用三來表達的。
中醫學術的主導思想是強調天人相應關係的運氣學說和異法方宜的地域學說，這些學說本身就與道家對天地的認識是一致的。日月的變化有日旦、日中、日暮；月生、月滿、月死。地域有東方、西方、中央；南方、北方、中央。都是三分的結果。因此中醫的陰陽學說，看起來好像是二分法，實際上是三分法。完全的陰陽關係均是由三方面組成：如陽分為太陽、陽明、少陽；陰分為太陰、厥陰、少陰。其中厥陰和少陽被認為介於陰陽之間，起到了沖氣的作用。在陰陽學說中，只要是談到與陰陽變化有關的內容，均是以三分法為基礎的。如《內經》中經絡的「開、合、樞」理論，《傷寒論》中六經分證，七日規律，講的就是從陽到陰，從病到治的關係，都是與三有關的變化。針灸刺法中的「一刺出陽邪，二刺出陰邪，三刺出谷氣」，表達外、內的陰陽關係，講的就是「天、人、地」，也是穴位中三層之間的變化，從而演變出諸如「燒山火」、「透天涼」等具體手法來。
中醫的陰陽觀，要點是「陰平陽秘，精神乃治；陰離決，精氣乃絕」，講的就是和諧。無論什麼疾病無外乎陰陽不調；醫生的治療手段雖然很多，無外乎協調陰陽。即使是最困難的治療，也離不開陰陽之間的協調關係，如王冰說的：「熱之不熱，是無火也，益火之源，以消陰翳；寒之不寒，是無水也，壯水之主，以制陽光」就是從原陰、原陽著手，從根本上解決陰陽不協調的高級治療方法。《內經》中很重視「亢則害，承乃制，制則生化」，其中「承」是關鍵。所謂「承」，就是和諧。要達到「承」，就得有沖氣的參與，『進行以三為相互關係的調整。
陰陽之間的相互關係，在治療學中的「從陰引陽，從陽引陰」，看起來只說到陰與陽，實際上講的是陰陽之間的轉化，而其轉化的方向是陰向陽轉化，陽向陰轉化，除了與沖氣有關之外，也與「負陰抱陽」十分相關。高血壓病人治療時，由於火氣上炎，中醫採用上病下治的方法；脫肛採用下病上治的方法；虛火擾神的失眠病人，中醫使用引火歸元的方法；針灸中的繆刺法等等，都是運用了陰陽轉化來達到陰平陽秘的效果。道家的氣化思想就這樣如此深化到中醫學術之中。
